Die Arbeit der Domschule Würzburg wird vom Verein „Katholische Akademie Domschule Würzburg e.V.“ getragen. Er handelt im Auftrag der Diözese Würzburg und wird von ihr unterstützt. Der Verein plant und organisiert Bildungsangebote innerhalb der kirchlichen Erwachsenenbildung. Diese richten sich nach dem jeweils gültigen Erwachsenenbildungsförderungsgesetz des Freistaates Bayern.